科技日報記者 張夢然
由新加坡科技研究局基因組研究所領導的科學家團隊，發布了迄今全球最大、最全面的長讀長RNA測序數據集之一——新加坡納米孔表達數據集（SG-NEx）。這一成果有望解決疾病研究中長期存在的技術瓶頸，使研究人員能夠更精確地解析RNA的復雜結構，為下一代精準診斷和治療策略奠定了堅實基礎。相關研究發表在最新一期《自然·方法學》期刊上。
短讀長RNA測序是現代轉錄組學的核心工具，但其局限性日益顯現。它通常無法完整捕獲全長RNA分子以及諸如剪接異構體、融合轉錄本等復雜變異，也無法識別影響疾病進展（如癌癥）的關鍵RNA化學修飾。這些缺陷限制了其在發現臨床相關生物標志物方面的應用潛力。
相比之下，SG-NEx采用的是長讀長RNA測序技術，能夠直接讀取完整的RNA分子，從而揭示更深層次的生物學信息，并顯著減少分析盲區。這種能力對于發現新的生物標志物和開發更精確的治療方法至關重要。
為了形象理解，可以將RNA比作一本書：短讀長測序就像將書頁撕成碎片后嘗試重建內容，容易遺漏細節且容易出錯；而長讀長測序則像是閱讀整頁甚至整章，使關鍵信息得以清晰呈現，特別是那些隱藏在與疾病相關的復雜RNA結構中的細節。
為最大化該數據集的影響力，SG-NEx項目采取快速公開發布數據策略，允許世界各地的研究者基于這些高質量數據開發并驗證新的RNA分析方法。這被認為是推動生物醫學發現、釋放長讀長測序潛力、改善疾病診斷和患者護理的重要一步。
目前，團隊正進一步推進項目發展，計劃開發用于自動化RNA特征識別的人工智能工具、擴大全球數據共享范圍，并推動長讀長測序方案的標準化。這些舉措將為長讀長RNA測序技術在臨床中的廣泛應用提供重要支撐。
總編輯圈點
傳統短讀測序像“拼碎片”，容易遺漏關鍵信息；長讀技術能直接“讀整頁書”，完整揭示關鍵信息。此次，新加坡科研團隊發布了全球最大、最全面的長讀長RNA測序數據集——SG-NEx，解決了傳統短讀測序技術難以捕捉復雜RNA結構的問題。SG-NEx還采取快速公開發布數據策略，全球研究者可利用其開發診斷工具。團隊下一步計劃推動長讀測序的標準化，為精準醫療和下一代RNA技術發展奠定基礎。
